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微生物是一类肉眼不能直接看见，必须借助光学显微镜或电子显微镜放大几百倍、几千倍甚至几万倍才能观察到的微小生物的总称。
微生物具有形体微小、结构简单；繁殖迅速、容易变异；种类繁多、分布广泛等特点。
根据微生物有无细胞基本结构、分化程度、化学组成等特点，可分为三大类。
1.非细胞型微生物无细胞结构，无产生能量的酶系统，由单一核酸（DNA/RNA）和蛋白质衣壳组成，必须在活细胞内增殖。病毒属于此类微生物。
2.原核细胞型微生物细胞核分化程度低，只有DNA盘绕而成的拟核，无核仁和核膜。这类微生物包括细菌、衣原体、支原体、立克次体、螺旋体和放线菌。
3.真核细胞型微生物细胞核的分化程度高，有核膜、核仁和染色体，能进行有丝分裂。如真菌、藻类等。
微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。涵盖了有益跟有害的众多种类，广泛涉及食品、医药、工农业、环保、体育等诸多领域。在我国教科书中，将微生物划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。
有些微生物是肉眼可以看见的，像属于真菌的蘑菇、灵芝、香菇等。还有微生物是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”。
微生物是指一切肉眼看不到或看不清楚，因而需要借助显微镜观察的微小生物。微生物包括原核微生物（如细菌）、真核微生物（如真菌、藻类和原虫）和无细胞生物（如病毒）三类。
体积小、表面积大
微生物的大小以μm计，但表面积大，必然有一个巨大的营养吸收，代谢废物排泄和环境信息接受面。这一特点也是微生物与一切大型生物相区别的关键所在。
分布广、种类多
分布区域广，分布环境广。生理代谢种类繁多，代谢产物种类繁多，代谢产物种类繁多。更重要的是，微生物有多种生理代谢和代谢产物。微生物可以在其他有机体生存的任何环境中发现，而微生物也可以存在于其他有机体无法生存的极端环境中。
吸收多、转化快
这一特性为高速生长繁殖和产生大量代谢物提供了充分的物质基础。
生长旺、繁殖快
生长繁殖率极高，如大肠杆菌在20-30分钟内分裂一次，如果连续分裂，48小时内2.2x1043个细菌数量增加，营养消耗、代谢积累和限制生长速度。这种特性可以在短时间内将大量的基板转化为有用的产品，缩短研究周期。还有一些缺点，如疾病、粮食霉变。
适应强、易变异
极其灵活适应性，对极端环境具有惊人的适应力，遗传物质易变异。易受环境条件的影响。在紫外线辐射、生物诱变剂和环境中的一些营养因子的变化中，微生物自觉地、强制性地改变其遗传结构，导致变异。据统计，在自然条件下，微生物个体变异的概率是百万分之一。
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